توضیحات
چکیده
تنوع ژنتیکی و ارزیابی ارقام مطرح بنفشهی آفریقایی(Saintpauli ionantha) در سطح مولکولی با استفاده از نشانگر RAPD انجام شد. به منظور استخراج DNAاز روش تغییر یافته Doyle and Doyle استفاده شد و در گام بعد ۶ ژنوتیپ با ۱۵ آغازگر مورد بررسی قرار گرفتند. از ۱۵ آغازگر مورد بررسی روی DNA ژنومی ۳۱۱ باند تولید شد که ۲۹۰ باند پلی مورفیسم داشتند. آغازگر I، کمترین باند و آغازگر G بیشترین باند را تولید کرد. اندازهی قطعات DNA تولید شده بین۲۰۰ بیس باز تا ۴۰۰۰ بیس باز بود. میانگین قدرت تفکیک نیز ۷۹/۰ بود. باندهای تولید شده برای آنالیزهای استاتیک مورد استفاده قرار گرفتند. برای رسم درخت فیلوژنیک از نرم افزار UPGMA استفاده شد. تشابه ژنتیکی بین ۵۷/۰ تا ۷۲/۰ است. و ضریب جاکارد بین دندروگرام و ماتریس تشابه ۷۸/۰ به دست آمدکه نشان دهنده برازش مناسب دندروگرام به ماتریس تشابه بوده است. نتایج به دست آمده نشان میدهد که نشانگر مولکولی RAPD ابزاری سودمند برای بررسی پراکندگی ژنتیکی و ارتباطات خانوادگی بین واریتههای بنفشهی آفریقایی است.
کلمات کلیدی: بنفشهی آفریقایی، مارکر مولکولی، تنوع ژنتیکی، آنالیزهای استاتیک، درخت فیلوژنی
فهرست
۱-۱٫ اهداف اصلاحی در بنفشه آفریقایی.. ۵
۱-۲٫ تنوع ژنتیکی و ضرورت شناخت آن.. ۶
۱-۳٫ روشهای برآورد تنوع ژنتیکی.. ۷
۱-۳-۱٫ برآورد تنوع ژنتیکی با استفاده از نشانگرهای دی ان ای.. ۸
۲-۱٫ گیاهشناسی بنفشه آفریقایی.. ۹
۲-۱-۱٫ میوه در Saintpaulia. 10
۲-۲٫ خاستگاه و پراکنش بنفشه آفریقایی.. ۱۱
۲-۳٫ گونههای مهم بنفشه آفریقایی.. ۱۱
۲-۳-۱٫ برخی گونههای فهرست شده به دنبال طبقه بندی Burtt12
۲-۴-۱٫ شرایط کشت بنفشه آفریقایی.. ۱۳
۲-۵٫ بیماریهای مربوط به بنفشه آفریقایی.. ۱۷
۲-۵-۱٫ بیماریهای ناشی از عوامل غیر زیستی.. ۱۷
۲-۵-۲٫ بیماریهای ناشی از عوامل زیستی.. ۱۸
۲-۶٫ اهمیت بنفشه آفریقایی.. ۲۰
۲-۷٫ اصلاح بنفشه آفریقایی.. ۲۱
۲-۱۰٫ روشهای ارزیابی تنوع ژنتیکی.. ۲۳
۲-۱۰-۱٫ نشانگرهای مورفولوژیکی.. ۲۳
۲-۱۰-۳٫ نشانگرهای مولکولی.. ۲۴
۲-۱۰-۴٫ نشانگرهای پروتئینی.. ۲۴
۲-۱۰-۶٫ نشانگرهای غیرمبتنی بر پی سی آر.. ۲۶
۲-۱۰-۷- نشانگرهای مبتنی بر پی سی آر.. ۲۷
۲-۱۰-۸٫ DNA پلی مورف تکثیر یافته تصادفی.. ۳۱
۲-۱۰-۸-۱٫ کاربرد به کارگیری تکنیک RAPD ……………………………………………………………………………………………32
۲-۱۰-۸-۲٫ کاربردهای نشانگر RAPD …………………………………………………………………………………………………….32
۲-۱۰-۸-۳٫ مزایای نشانگرهای RAPD ……………………………………………………………………………………………………….32
۲-۱۰-۸-۴٫ معایب نشانگرهای RAPD …………………………………………………………………………………………………..34
۲-۱۰-۸-۵٫ ویژگیها و کاربردهای نشانگرهای مرتبط با RAPD ……………………………………………………………….35
۲-۱۱٫ واکنش زنجیره پلیمراز.. ۳۷
۲-۱۱-۱٫ اجزای واکنش زنجیره‌ای پلیمراز(PCR).. 38
۲-۱۱-۳٫ کاربردهای پی سی آر.. ۴۱
۲-۱۲-۱٫ الکتروفورز ژل آگارز.. ۴۳
۲-۱۳-۱٫ پیچیدگی ژنوم و بررسی فیلوژنتیک:.. ۴۵
۲-۱۳-۲٫ اندازه‌گیری فواصل و تشابهات ژنتیکی.. ۴۹
۲-۱۳-۳٫ روشهای آماری برای تجزیه و تحلیل تنوع ژنتیکی.. ۵۰
۲-۱۳-۵٫ ضریب همبستگی کوفنتیکی.. ۵۱
۲-۱۳-۶٫ تجزیه به مؤلفههای اصلی.. ۵۱
۲-۱۴٫ مروری بر تحقیقات پیشین.. ۵۲
فصل سوم……………………………………………………………………………………………………………………………………………………۵۷
۳-۳٫ تعیین کیفیت نمونههای DNA.. 59
۳-۴٫ تعیین کمیت نمونههای DNA.. 60
۳-۵٫ تنظیم غلظت نمونههای DNA 60
۳-۷٫ انجام واکنش‌های زنجیره‌ای پلیمراز.. ۶۰
۳-۸٫ الکتروفورز فراورده‌های PCR.. 62
۳-۹٫ تجزیه و تحلیل‌های آماری.. ۶۲
۴-۱٫ تعیین کمیت و کیفیت DNA ژنومی.. ۶۴
۴-۲٫ واکنش زنجیره‌ی پلیمراز.. ۶۵
۴-۳٫ تجزیه باندهای ایجاد شده.. ۶۶
۴-۳-۱٫ بررسی محتوای اطلاعاتی به دست آمده.. ۶۷
۴-۴٫ تجزیه خوشه‌ای.. ۷۲
۵-۲٫ واکنش زنجیره پلیمراز………………………………………………………………………………………………………………………..۷۵
۵-۲-۱٫ بهینه سازی مواد به کار رفته در پی سی آر………………………………………………………………………………………………۷۵
۵-۲-۲٫ بهینه سازی شرایط پی سی آر…………………………………………………………………………………………………………..۷۵
دیدگاهها
هیچ دیدگاهی برای این محصول نوشته نشده است.